保护区内植物物种资源丰富，植被类型复杂，区内有珙桐、水青树、连香树等国家一、二、三类珍稀保护植物18种左右。在本区白岩沟有30余公顷珙桐纯林带，暴河岩沟至银厂一带广泛散生珙桐、连香树等珍稀植物。随海拨高度的上升，植被垂直分布带明显。
保护区内已知兽类46种、鸟类型164种、鱼类7种、爬行类14种。其中有大熊猫、扭角羚、金丝猴、小熊猫、水鹿、豹、川陕哲罗鲑等国家一、二级重点保护野生动物共32种。目前区内动物种群以扭角羚及水鹿两种种群数量大，分布在区内的大部分区域，大熊猫分布在从索索棚沟到石板沟的广大区域内，但种群数量较少。
